台灣媽祖魚保育聯盟分析，現有個體老化又沒有新的個體誕生，族群數量一直無法擴大。而目前統計，從2000年到2019年擱淺的個體數就有11隻，更讓人擔心族群數量面臨威脅。而專家表示，最近幾年發現的鯨豚，外觀多有碰撞的傷痕，除了和漁業活動有關，海上開發案的進行可能也是鯨豚的衝擊來源。國立自然科學博物館助理研究員姚秋如說：「人為的開發壓力很大，包含海岸的人工化，以及海上會有些工程（海上風機），在這個過程中，船隻來往等等都可能造成鯨豚生活被影響。」
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